Описание свойств Сукцинат дегидрогеназы, часть А из кишечной палочки в производных базах данных
Для описания свойств были использованы следующие базы данных:
- Prosite - база данных, в которой содержатся биологически значимые сайты, паттерны и профили.
- Pfam - база данных, в которой содержится большая коллекция множественных выравниваний, доменов, семейств и профилей-HMM для них. Она удобна для анализа доменной структуры белков.
- InterPro - появился в 1999 году, это интегрированый ресурс белковых семейств, доменов и функциональных сайтов.
Нам были даны задания:
- Определить, какие известные мотивы ести в изначально данной нам последовательности (Prosite)
- Описать доменную структуру этого белка по данным Pfam.
- Поработать с документом интегрированной базы данных Interpro
- Доменная структура
- Мотивы в аминокислотной последовательности
- Данные InterPro
Назад
Главная страница