Описание свойств Сукцинат дегидрогеназы, часть А из кишечной палочки в производных базах данных
Для описания свойств были использованы следующие базы данных:
  1. Prosite - база данных, в которой содержатся биологически значимые сайты, паттерны и профили.
  2. Pfam - база данных, в которой содержится большая коллекция множественных выравниваний, доменов, семейств и профилей-HMM для них. Она удобна для анализа доменной структуры белков.

  3. InterPro - появился в 1999 году, это интегрированый ресурс белковых семейств, доменов и функциональных сайтов.

Нам были даны задания:
  1. Определить, какие известные мотивы ести в изначально данной нам последовательности (Prosite)
  2. Описать доменную структуру этого белка по данным Pfam.

  3. Поработать с документом интегрированной базы данных Interpro

  1. Доменная структура
  2. Мотивы в аминокислотной последовательности

  3. Данные InterPro

Назад
Главная страница