Доменная структура Сукцинат дегидрогеназы, часть А из кишечной палочки
База данных PFAM включает 7426 записей с краткой характеристикой разных семейств белковых доменов, включая их множественные выравнивания. . Каждый домен в PFAM описан с помощью HMM-профилей.
Изображение доменной структуры SdhA_Ecoli:
ДОМЕН №1
Fad binding 2.
Расположение в последовательности: 108-440
Идентификатор записи в PFAM: PF00890
К этому домену присоединяется флавинадениндинуклеотид, ковалентно связываясь с гистидином, который находится в N-конце.
Функция – оксиредуктазная активность.
Участвует в электронном транспорте
ДОМЕН №2
Low complexity region.
Расположение в последовательности: 443-452
Собственно говоря, это не домен, а регион-мозаика, состоящий из небольшого числа аминокислотных остатков. Эти регионы показаны, как достаточно важные в некоторых белках, но они не очень хорошо изучены.
ДОМЕН №3
Succ_DH_flav_C
Расположение в последовательности: 460-588
Идентификатор записи в PFAM: PF02910
Это С-концевой домен флавопротеина - фумаратная редуктаза/сукцинатная дегидрогеназа.
Картинка. Наложение доменной структуры на пространственную структуру белка.
Зеленым цветом отмечен домен №1, желтым – домен №2, красным – домен №3.
Назад
Главная страница
