Архея Methanosarcina mazei и родственные виды имеют большое экологическое значение, так как это единственные организмы, расщепляющие уксусную кислоту, метиламины и метанол до метана, углекислого газа и аммиака (в случае метиламинов). Только виды из рода Methanosarcina владеют всеми тремя известными методами метаногенеза и способны разлагать множество метанородных веществ, включая уксусную кислоту. Они вырабатывают метан в процессе круговорота углерода в природе (метан - это как потенциальный альтернативный источник энергии, так и парниковый газ). Некоторые гены Methanosarcina mazei имеют сильное сходство с генами бактерий. Это говорит о том, что латеральный перенос генов сыграл болшую эволюционную роль в формировании физиологии этого метаболически непостоянного метаногена.
Klunker D, Haas B, Hirtreiter A, Figueiredo L, Naylor DJ, Pfeifer G, Muller V, Deppenmeier U, Gottschalk G, Hartl FU, Hayer-Hartl M.
Два отдаленно родственных класса цилиндрических комплексов шаперонинов помогают в заворачивании новосинтезированных и денатурированных белков с использованием энергии АТФ. Считается, что шаперонины группы I располагаются только в цитозоли бактерий, а также в митохондриях и хлоропластах, в то время как шаперонины группы II находятся в цитозоли архей и эукариотов. В данной работе показано, что некоторые виды архей из рода Methanosarcina синтезируют как полный вариант системы шаперонинов группы I (GroEL/GroES), так и группы II (thermosome/prefoldin). Эти мезофильные археи получили от 20 до 35% своих генов в результате латерального переноса генов от бактерий. У Methanosarcina mazei Go1 оба шаперонина синтезируются примерно в одинаковом количестве, и их количество немного увеличивается при увеличении температуры. Белки GroEL/GroES археи M.mazei имеют структурные особенности своих бактериальных аналогов. Thermosome содержит три paralogous subunit: альфа, бета и гамма, которые обычно находятся в молярном соотношении 2:1:1. Как показали лабораторные эксперименты, их совместное действие зависит от АТФ/Mg2+ или АДФ/Mg2+ и регуляторной роли бета-субунита. Сосуществование обоих систем шаперонинов в одном клеточном компартменте предполагает, что Methanosarcina mazei - это полезные макетные системы для изучения шаперонинов группы I и группы II и того, как новосинтезированные белки поступают от рибосом к нужному шаперонину для заворачивания.
PMID: 12796498 (methanosarcina mazei AND complete genome AND 2000:2010[DP] - 3)
Статья об архее(.pdf) (Scott I. Hauenstein and John J. Perona)
| Component name | Chromosome | |
| Protein count | 3363 | 3303 |
| Length (bp) | 4096345 | |
| Av. CDS length | 912.107 | |
| GC content | 41.5% | |
| CDS coverage | 75% | |
| Gene count | 3363 |
Хромосомная таблица и гистограмма длин белков (.xls)
