Abinitio вычисления для нафталина и азулена

Вернуться к списку занятий



  • Задание 1.

    • SMILES азулена: C1=CC=C2C=CC=C2C=C1
    obgen a.smi -ff UFF> au.mol
    силовые поля: MMFF94, MMFF94s силовое поле UFF


    SMILES нафталина: c1ccc2ccccc2c1
    obgen n.smi > n.mol

    babel -imol au.mol -omop au.mop -xk PM6
    MOPAC2009.exe au.mop
    babel -imopout au.out -ogamin au.inp

  • Задание 2.


    • Оптимизация GAMESS:
    gms au.inp 1 >& au.log - азулен
    gms nu.inp 1 >& nu.log - нафталин
    Базис - N31.

  • Задание 3.

    • метод Хатри-Фока:
    Входные файлы: азулен, нафталин.
    Полученные файлы: азулен, нафталин.

    теория функционала плотности:
    Входные файлы: азулен, нафталин.
    Полученные файлы: азулен, нафталин.

  • Задание 4.

    • Вещество Хартри-Фок теория функционала плотности
    Нафталин -383.3546611998 -385.6400108661
    Азулен -383.2824690219 -385.5857491456
    Δ, Hartree 0,0721921779 0,0542617205
    Δ, kCal/mol 45,3 34,05

    К экспериментальному значению энергии изомеризации нафталина в азулен (35.3±2.2 kCal/mol) приближается энергия, полученная по методу теории функционала плотности, следовательно, этот метод лучше.

    © Karavaeva Julia 2009