Молекулярное Моделирование Биополимеров

1. Знакомство с PyMol

2. Работа с PyMol

3. Cеми-эмпирические вычисления: Mopac

4. Abinitio вычисления для нафталина и азулена

5. Вычисление параметров для молекулярной механики

6. Вычисление точечных зарядов и VdW параметров для молекулярной механики

7. Изучение работы методов контроля температуры в GROMACS

10. Гомологичное моделирование комплекса белка с лигандом

11. Докинг низкомолекулярных лигандов в структуру белка

12. Пример использования трехмерного QSAR анализа для предсказания активности низкомолекулярных соединений в отношении данного белка

13.Расчёт энергии сольватации димера из двух мономеров полиэтиленгликоля методом FEP