| Далее с помощью программы Stride были найдены вторичные структуры белка. Визуализация, полученная этой программой представлена ниже. Также был получен текстовый файл с данными о структуре. Также ниже представлена информация о положениях этих структур из PDB-файла белка. |
 |
| рис. 2 Выдача программа Stride, белок 6A3Z (бета листы - зеленый цвет, альфа-спирали - красный) |
|
 |
| рис. 3 Информация о альфа-тяжах и бета-листах белка 6A3Z из PDB-файла |
|
| Согласно PDB положение альфа-тяжей: THR2-ALA8 и THR35-PHE42, а согласно данным программы Stride эти же структуры имеют положения: PRO3-ALA8 и THR35-PHE42 соответсвенно. Как видно, различие небольшое - в одну аминокислоту в одном из тяжей (В Stride граница меньше). Что касается бета-листов, в PDB они имеют положения: ALA24-ARG26 и ILE32-HIS34, а в Stride: ALA24-LEU27 и HIS31-HIS34. Как видно, в обоих случаях границы больше в Stride на одну аминокислоту. |
