Изображение дерева
Цель занятия - поработать с филогенетическим деревом нескольких бактерий.
Из предложенного списка бактерий отдела Firmicutes случайным образом были выбраны следующие 8 бактерий:
| Название | Мнемоника |
| Clostridium tetani | CLOTE |
| Finegoldia magna | FINM2 |
| Lactobacillus delbrueckii | LACDA |
| Enterococcus faecalis | ENTFA |
| Lactococcus lactis | LACLM |
| Streptococcus pneumoniae | STRPN |
| Listeria monocytogenes | LISMO |
| Geobacillus kaustophilus | GEOKA |
На основе приведённого (в задании) филогенетического дерева было составлено филогенетическое дерево для выбранных организмов. Ниже указана скобочная формула составленного дерева (в формате Newick):
((CLOTE,FINM2),((LACDA,(ENTFA,(LACLM,STRPN))),(GEOKA, LISMO)));
С помощью программы MEGA было создано изображение дерева:
Если считать нетривиальной ветвью такую, которая разбивает множества листьев на подмножества, в каждом из которых более одного элемента, то данное дерево содержит пять нетривиальных ветвей: