Особенности "features" белка:

1) Первая особенность бромающаяся в глаза - одинаковой длины, симметричные альфа спирали, которые являются характеристическим признаком трансмембранных белков у эукариотных организмов. Хотя у бактерии этот белок вовсе не трансмембранный.
2) С лигандом образуется 4 связи, 2 сильных и 2 частичных, что играет существенную роль в активности белка.
3) Длина всей цепочки - 442 аминокислотных остатка, исходя из этого, можно говорить о высокой реакционной способности белка и относить его скорее к классу ферментов, чем к классу трансмембранных белков.

MOXC_BACSU в SRS

Мой белок имеет неразрывную цепь в комплексе с FMN, также содержит множество альфа-спиралей и 3 бета-поворота.

Информация об особенностях белка находится тут или здесь.

MOXC_BACSU в PDB

Записи банка трехмерных структур PDB, относящиеся к белку moxc_bacsu.

Задание 3

Формулировка функции белка	Строка запроса	Количество найденных документов
Putative monooxygenase ytnJ	(((([swissprot-Description:putative monooxygenase*] & [swissprot-Description:monooxygenase*]) & [swissprot-Description:ytnJ*]) | [swissprot-Description:putative monooxygenase MoxC ytnJ*] ) & [swissprot-Taxonomy:Firmicutes*])	1
Monooxygenase	([swissprot-Taxonomy:Firmicutes*] & [swissprot-Description:monooxygenase*])	1
Putative mooxygenase	([swissprot-Taxonomy:Firmicutes*] & ([swissprot-Description:putative*] & [swissprot-Description:mooxygenase*]))	1
FMN	([swissprot-Taxonomy:Firmicutes*] & [swissprot-Description:FMN*])	1

Задание 4 (последовательности белка)

Представленные здесь последовательности принадлежат уникальному и неповторимому белку рода Bacillus

Задание 5 (список последовательностей из задания 4)

Здесь

Задание 6

Страница "Taxonomy" банка Swissprot

bacillaceae

bacillales

bacillariaceae

bacillariales

bacillariophyceae

bacillariophycidae

bacillariophyta

bacilli

bacillus

Записи в Swissprot связанные с именем А. А. Нейфаха

([swissprot-Authors:Neyfakh*] > parent ) & ([swissprot-RefNumber#1:1] > parent)