Главная страница
term4 🕓

Ферменты и метаболические пути. База данных KEGG.

TASK1. Работа с KEGG PATHWAY
Общие сведения о метаболическом пути XXX
	Аргинин - это аминокислота с основными свойствами. Аргинин и его предшественник орнитин участвуют в биосинтезе широко распространенных 
в организме полиаминов (путресцина и спермидина), которые необходимы для правильного развития организма. К тому же аргинин в
случае азотного голодания выступает в качестве поставщика азота.
        Аргинин синтезируюется из глутамата в 8 стадий. Путь состоит из 5стадий, в ходе которых из N-ацетилированного глутамата образуется
орнитин, и еще 3,в результате котрых орнитин конвернитруется в аргинин.
	Биосинтез аргинина связан с другими путями,а именно:

M00020 Citrate cycle(2-Oxoglutarate, Fumarate) M00029 Urea cycle M00763 Ornithine biosynthesis, mediated by LysW, glutamate => ornithine M00910 & M00240 Nitrogen & Pyrimidine matabolisms, mediated by Carbamoil-P M00845 Arginine biosynthesis, glutamate => acetylcitrulline => arginine M00250 Alanine,Aspartate and glutamate metabolism, mediated by aspartate
Ссылка на страницу биосинтеза аргинина: map00220

ARGININE BIOSYNTHESIS 
вещества, через которые осуществляется связь с другими биологическими путями, подчеркнуты сиреневым

Метаболический путь биосинтеза аргинина в разных доменах жизни
1. Eukaryotes: Hydra vulgaris (Cnidarians,Animals)
2. Archaea: Methanosarcina vacuolata (Methanosarcina,Euryarchaeota)
3. Bacteria: Brucella Vulpis (Alphaproteobacteria,Proteobacteria)
Посмотрев на карты метаболических путей всех трех организмов, можно убедиться, что каждый из них способен синтезировать аргинин, так как у каждого изображена
цепь реакций, сопровождаемых соответствующими ферментами.  

1. Eukaryotes' ARGININE BIOSYNTHESIS 

2. Archaea's ARGININE BIOSYNTHESIS 

3. Bacteria's ARGININE BIOSYNTHESIS 
TASK2. 2. Работа с KEGG REACTION

Реакция гидролиза LysW-L-ornithine с образованием Lys в базе данных KEGG
Ссылка на страницу с реакцией: R10933
Идентификатор реакции в базе данных KEGG: R10933

на карте биосинтеза аргинина реакция гидролиза LysW-L-ornitine
расположена в красной рамке

3. Здесь: C20951 = лизинW-L-орнитин,
C00001 = вода, C00077=лизин, C19885=альфа-аминоадипиновый переносчик лизинаW

© Цыганов Кирилл, 2017