Водородные связи. Подвижность белков

Первый скрипт (кнопка Hbonds) покажет водородные связи между белком и цепью ДНК. Второй скрипт (кнопка PatMobility) продемонстрирует подвижность структур в ДНК-белковом комплексе.
Для продолжения нажмите Resume.

Текст скрипта 1 задания
Текст скрипта 2 задания

Jmol output:

Первый скрипт показывает 21 водородную связь между ДНК и наиболее близкими частями белка. Их длина составляет в среднем 0,3 нм.
Водородные связи в ДНК-белковом комплексе нужны для сохранения определённой пространственной структуры. Через них осуществляется связывание ДНК, РНК и белков в особую структуру - хроматин. В таком состоянии идёт активный биосинтез белков, РНК, самоудваивается ДНК.

Максимальное расстояние между моделями
Состояние участка белка	Остов	Боковая цепь
структурированная часть	2.596222	10.3338785
неструктурированная часть	12.921888	16.356113

Расчитав расстояние между моделями атомов из разных частей белка, можно сделать вывод о наиболее подвижных его частях.
В неструктурированных частях белка наблюдается большая подвижность, чем в альфа-спиралях и бета-тяжах. Причём атомы, наиболее удалённые от остова, подвижнее.Это можно объяснить тем, что структурированные части играют ключевую роль в пространственном расположении атомов активного центра белка, поэтому их положение относительно жёстко фиксировано.

«Назад
Дальше»