Описание доменной структуры белка RIR2_ECOLI

Идентификатор Pfam Сокращённое название Полное название на русском языке Положение домена в последовательности (номера а.о.)
PF00268 Ribonuc_red_sm Рибонуклеотид редуктаза, малая цепь. 202–313

PDB картинки моего белка не было.

Встречаемость белков с доменом Ribonuc_red_sm в различных таксонах.

Рибонуклеотид редуктаза катализирует востановительный синтез дезоксирибонуклеотидов из их рибонуклеотидов:

2'-deoxyribonucleoside diphosphate + oxidized thioredoxin + H2O = ribonucleoside diphosphate + reduced thioredoxin

Она обеспечивает предшественников необходимых для синтеза ДНК. Рибонуклеотидная редуктаза - олигомерный фермент, составленный из большой субъединицы (700 - 1000 остатков) и маленькой субъединицы (300 - 400 остатков). Маленькая цепь связывает два атома железа (три Glu, один Asp, и два His вовлечены в закрепление металла), и содержит активный участок тирозин радикал.

Таксон Количество белков с доменом PF00268
Эукариоты Растения 7
Грибы 13
Животные 29
Бактерии 160
Археи 2

Анализ основных типов доменной архитектуры белков, содержащих домен Ribonuc_red_sm.

  1. Что бывает чаще, домен Ribonuc_red_sm - единственный домен в белке, или домен Ribonuc_red_sm встречается в белках в сочетании с другими доменами?
        Чаще домен Ribonuc_red_sm - единственный домен в белке (595 случаев).
  2. Известны ли случаи дупликации домена Ribonuc_red_sm ?
        Да (6 случаев).
  3. Известны ли случаи перестановки 2-х доменов местами, если один из доменов – Ribonuc_red_sm ?
        Нет.

В начало страницы.
На страницу оглавления.

©Кулагин Константин, 2005