Реконструкция филогенетического дерева с помощью 4-х разных методов

Таблица топологий получившихся деревьев

Ветвь	Исходное дерево модели	UPGMA	NJ	ML	Parsimony
ABCDEF
110000	+	+	+	+	+
111000	+	+	+	+	+
111100	+	+	+	+	+

Видно, что ни один из методов не ошибся, что говорит о их выскокой эффективности.
Ниже приведены деревья, предложенные каждой из указанных программ:

UPGMA method +--------------leafA +-------------1 +-------------2 +--------------leafB ! ! --5 +----------------------------leafC ! ! +---------------------------------------leafD +--4 ! +-----------------------------------leafE +---3 +-----------------------------------leafF (((leafA:0.25195,leafB:0.25195):0.24055,leafC:0.49250):0.22779, (leafD:0.67097,(leafE:0.60665,leafF:0.60665):0.06432):0.04932);

Neighbor-joining method +------------------------------------leafE ! --4-----------------------------------leafF ! ! +----------------leafA ! +--------------1 ! +---------------2 +--------------leafB ! ! ! +-----3 +---------------------------leafC ! +-------------------------------------leafD (leafE:0.61334,leafF:0.59996,(((leafA:0.26836,leafB:0.23554):0.26109, leafC:0.47196):0.25563,leafD:0.62707):0.10823);

Maximum Likelihood method +-------leafB ! ! +-----------------------leafF ! +----4 ! +------------3 +---------------------------leafE ! ! ! --1--------2 +--------------------------leafD ! ! ! +-------------------leafC ! +---------leafA (leafB:0.25315,(((leafF:0.79826,leafE:0.92760):0.16073, leafD:0.87746):0.41463,leafC:0.64173):0.30216, leafA:0.32060);

Parsimony method +--leafF +--5 +--4 +--leafE ! ! +--3 +-----leafD ! ! +--2 +--------leafC ! ! --1 +-----------leafB ! +--------------leafA (((((leafF,leafE),leafD),leafC),leafB),leafA);