Описание ферментативной реакции

Субстрат	Oxalosuccinate
Продукт	2-Oxoglutarate
Уравнение реакции	Oxalosuccinate <=> 2-Oxoglutarate + CO2
Изображение реакции с помощью структурных формул
Название фермента	Дегидрогеназа цитрата (NADP+)
Код фермента и его расшифровка	EC 1.1.1.42 1 — Оксидоредуктазы (катализируют окислительно-восстановительную реакцию) 1.1 — Оксидоредуктазы, действующие CH-OH группы доноров 1.1.1 — Акцептором в реакции выступает НАД+ или НАДФ+ 1.1.1.42 — Дегидрогеназа цитрата (NADP+)
Название метаболического пути	Цитратный цикл (TCA цикл)
Из чего мог появиться заданный субстрат	В данном метаболическом пути — только из изоцитрата. Причём является продуктом реакции с темже ферментом (1.1.1.42)
Во что дальше может превратиться продукт	В 3-Карбокси-1-гидроксипропил-ThPP

Ферменты разного типа, катализирующие одну и ту же реакцию

   Поиск ферментов проводился по пути метаболизма аргинина и пролина (Arginine and proline metabolism).
   При введении в строку для поиска названия пути на запрос выдаётся очень большое число ссылок. Большинство из них ведут на страницу с картой данного пути для определённого организма, причём ферменты, имеющиеся в этом организме, выделены зелёным. Ссылки на карты путей метаболизма, не относящихся к конкретному организму, содержат сочетание букв "map", а заголовок страницы содержит слово "reference", поэтому для более быстрого поиска эти слова следует также ввести в запрос.

На карте пути метаболизма аргинина и пролина реакцию превращения D-Пролина в 5-Амино-пентонат катализуруют 2 фермента— 1.21.4.1 и 1.4.1.12

   Уравнение реакции: 5-Амино-пентонат + Липоат <=> D-Пролин + Дигидролипоат

Параметр сравнения	Первый фермент	Второй фермент
Ферментативный код	EC 1.21.4.1 1 — Оксидоредуктазы (катализируют окислительно-восстановительную реакцию) 1.21 — Оксидоредуктазы, действующие на X-H и Y-H чтобы сформировать X-Y связь 1.21.1 — С дисульфатом как акцептор 1.21.1.51 — D-пролин редуктаза (дитиол)	EC 1.4.1.12 1 — Оксидоредуктазы (катализируют окислительно-восстановительную реакцию) 1.4 — Оксидоредуктазы, действующие на CH-NH2 группе доноров 1.4.1 — С NAD+ или NADP+ как акцептор 1.4.1.12 — 2,4-диаминопентанат дегидрогеназа или 2,4-диаминопентановая кислота C4 дегидрогеназа
Метаболические пути, в которых фигурирует данный фермент	Метаболизм аргинина и пролина	Метаболизм аргинина и пролина; Деградация лизина; Метаболизм D-аргинина и D-орнитина.
Известные ингибиторы	-	-

Cравнение пути биосинтеза тирозина из хоризмата у мыши и кишечной палочки

   Название пути: Биосинтез фенилаланина тирозина и триптофана.
   Идентификаторы использованных карт: mmu00400 (для Mus musculus) и eco00400 (для штамма Escherichia coli K-12 MG1655).
   Ниже можно видеть карту заданного пути метаболизма:
   Для осуществления синтеза тирозина из хоризмата необходимо осуществление реакции хоризмат <=> префенат (единственный способ в этом пути метаболизма получить префенат). Далле есть множество различных путей получения тирозина, но все они идут через промежуточные соединения: фенилпируват, претирозин и 4-гидрокси-фенилпируват.
   Ниже расположены изображения участка карты, описывающего превращение пирувата в треонин у мыши (слева) и кишечной палочки (справа):

   В организме кишечной палочки возможен процесс синтеза префената из хоризмата и три из четырёх возможных реакций для образования промежуточных соединений, но синтез тирозина идёт только из одного соединения (4-гидрокси-фенилпирувата)
   У мыши нет ни одного фермента ни для синтеза префената из хоризмата, ни для синтеза промежуточных соединений (то есть мыш вообще не может синтезировать тирозин), хотя есть ферменты для синтеза самого тирозина.
   Отсюда можно сделать вывод, что тирозин для мыши является незаменимой аминокислотой, а для кишечной палочки — заменимой. Однако утрата ферментов, синтезирующих тирозин для кишечной палочки может стать гибельным, если эта аминокислота не поступает в её клетку извне.

В начало страницы.
На главную страницу.