Я поменяла следующие параметры: Database(UniProtKB/Swiss-Prot(swissprot)), Max target sequences(500).

Общее количество находок 70

Первые 6 последовательностей были выбраны для выравниваний

гомологи зрелого вирусного белка, вырезанного из полипротеина

Запрос: (protein_name:polyprotein) AND (taxonomy_id:11118)

Выбранный белок:

ID R1A_BCHK3

AC P0C6F8; Q3LZX2;

Bat coronavirus HKU3 (BtCoV)

Из составляющих белков был выбран 3C-like proteinase nsp5(3235..3540)

FASTA файл

вход BLAST с вырезанным из полипротеина зрелым белоком

Выравнивание

Исследование зависимости E-value от объёма банка

При применении фильтра количество находок осталось прежним(58)

У белка P0C6T6.1 E value поменялся с 9е-106 до 4е-107. Доля вирусных белков в Swiss-Prot: 4е-107/9е-106=0.04

вход BLAST с фильтром