Занятие 10
Эволюция доменной архитектуры
АС выбранного домена:PF00657ID:GDSL-like Lipase/Acylhydrolase
Функция: группа липолитических энзимов с остатков серина в активном центре.
В базе данных Pfam представлено 66 архитектур с выбранным доменов
Представленность домена в различных таксонах:(3198 последовательностей-737 видов)
Archaea: 3
Bacteria: 929
Eukaryota: 2259
Viruses: 2
unclassified: 5
ссылка на страницу домена в Pfam
Проект выравнивания последовательностей, содержащих выбранный домен (+3D структура одного домена)
Выбранные архитектуры:
Однодоменная архитектура Lipase_GDSL (2716 последоваетельностей)
Двудоменная архитектура:
Autotransporter (PF03797) - автотранспортерный домен-структурный домен некоторых внешних трансмембранных белков грамположительных бактерий. Образует 119 архитектур, 4980 последовательностей в 838 видах.
Результаты:
Совместное выравнивание последовательностей,содержащих выбранные архитектуры
Таблица с описанием архитектур