Эволюционная модель

В нашей эволюционной модели мы мутировали исходный ген белка beta-galactosidase,используя программу msbar пакета Emboss.
Получили мутантные последовательности, соответствующие всем узлам дерева.
Данная скобочная структура:
( (A:80,B:80):20, ( ((C:20,D:20):10, E:30):80, F:80):10 );
Дерево событий

Cкрипт, позволивший получить последовательности 

msbar  eclac.fasta aaa.fasta -point 4 -count 620 -auto
msbar  eclac.fasta ddd.fasta -point 4 -count 310 -auto
msbar  aaa.fasta A.fasta -point 4 -count 2480 -auto
msbar  aaa.fasta B.fasta -point 4 -count 2480 -auto
msbar  ddd.fasta eee.fasta -point 4 -count 2480 -auto
msbar  ddd.fasta F.fasta -point 4 -count 2480 -auto
msbar  eee.fasta E.fasta -point 4 -count 930 -auto
msbar  eee.fasta hhh.fasta -point 4 -count 310 -auto
msbar  hhh.fasta C.fasta -point 4 -count 620 -auto
msbar  hhh.fasta D.fasta -point 4 -count 620 -auto

Анализ модели

  1. Определение эволюционного расстояния между нуклеотидными последовательностями

  2. Сравнение методов реконструкции деревьев

НА ГЛАВНУЮ