Для получения последовательностей белков организма относительно близкого к Amoeboaphelidium protococcarum (Saccharomyces cerevisiae) использовалась команда:
seqret sw:*** out.fasta (где вместо звездочек АС белка)
В результате я получил три белка:
Сравнение белков с геномом было осуществлено с помощью команды:
tblastn -query NAME.fasta -db X5.fasta > NAME.txt
Результат:
Все три белка являются гомологами, о чем свидетельствует e-value 0. И достаточно хорошие проценты идентичности: 89%, 44% и 75% соответственно.