Левин И., 4-й семестр, практикум 12

Метаболические пути, KEGG

Вопрос 1

Рис. 1. Мой референсный путь map00472

Вопрос 2

Рис. 2. Мой референсный путь map00472 с отмеченной синим реакцией K00273

Вопрос 3

Описание выбранной мною реакции: мне попалась реакция дезаминирования с участием оксидазы.

Д-орнитин + H₂O + O₂ <=> 2-оксо-5-аминовалерат + NH₃ + H₂O₂

Рис. 3. Схема реакции K00273

Вопрос 4

Фермент, катализирующий выбранную мной реакцию: D-аминокислотная оксидаза (EC 1.4.3.3).

Вопрос 5

Функции фермента: по сути, он катализирует реакцию дезаминирования D-аминокислоты с использованием молекулы кислорода.

EC 1 - Оксидоредуктазы;
EC 1.4 - Оксидоредуктазы, взаимодействующие с CH-NH₂ группой доноров;
ЕС 1.4.3 - Оксидоредуктазы, использующие, как акцептор, кислород;
EC 1.4.3.3 - моя D-аминокислотная оксидаза.

Вопрос 6

Рис. 4. Референсный путь hsa00472, специфичный для человека, с подсвеченной (почему-то) зелёным выбранной мною реакцией

Рис. 5. Референсный путь ptr00472, специфичный для шимпанзе, с подсвеченной (почему-то) зелёным выбранной мною реакцией

Вопрос 7

Число метаболических путей для шимпанзе: 522;

Число генов для шимпанзе: 26314.