Описание генома Mamastrovirus 13

       По типу носителя генома вирус Mamastrovirus 13 (русское название мне неизвестно) классифицируется как ssRNA positive-strand viruses, no DNA stage, то есть носителем информации является одноцепочечная РНК положительной полярности. Это означает, что транслируется РНК, входящая в состав вируса, а не комплементарная ей.

       Геном этого вируса состоит из одной молекулы РНК, которая содержится в записи NC_002469.1 банка RefSeq. Состоит из 6440 нуклеотидов. В геноме закодировано 3 гена, но один ген полностью входит в состав другого, поэтому в общем числе генов не учитывается (по данным NCBI). Информация о генах приведена в таблице 1.

Таблица 1. Гены в геноме вируса Mamastrovirus 13

       Все гены находятся на одной цепи (т.к. вирус РНКовый). Первый и второй ген сильно перекрываются – первый от 46 до 4100, а второй от 46 до 2580 – перекрываются на 2535 нуклеотида. Первый и третий слабо перекрываются – первый от 46 до 4100, а третий от 4093 до 6381 – перекрываются на 8 нуклеотидов. Длина всех генов делится на 3. Графическое изображение всего генома вируса Mamastrovirus 13 приведено на Рис. 1. На Рис. 2 показана зона перекрывания первого и пятого генов в приближении.

Рисунок 1. Изображение всего генома вируса Mamastrovirus 13. Рисунок получен с помощью геномного браузера на сайте NCBI (http://www.ncbi.nlm.nih.gov)

Рисунок 2. Зона перекрывания первого и пятого генов в геноме Mamastrovirus 13. Рисунок получен с помощью геномного браузера на сайте NCBI (http://www.ncbi.nlm.nih.gov)