ПЕРВЫЙ СЕМЕСТР |  главная страница  |  первый семестр  |  второй семестр  |


Карта Рамачандрана

Определение торсионных углов φ, ψ и ω у десятого аминокислотного остатка RSGA_BACSU

Название
двугранного
угла 		Угол определяется по координатам атомов
(обращение к атому в соответствие с синтаксисом RasMol,
в скобках – название атома) 		Данный угол описывает
поворот вокруг связи 		Результат измерения
с помощью RasMol
φ
  1. ALA9:A.C (карбонильный углерод 9-го остатка цепи А)
  2. LEU10:A.N (остовный азот 10-го остатка цепи А)
  3. LEU10:A.CA (альфа-углерод 10-го остатка цепи А)
  4. LEU10:A.C (карбонильный углерод 10-го остатка цепи А)
N10 - Cα10 -151,79°
ψ
  1. LEU10:A.N (остовный азот 10-го остатка цепи А)
  2. LEU10:A.CA (альфа-углерод 10-го остатка цепи А)
  3. LEU10:A.C (карбонильный углерод 10-го остатка цепи А)
  4. LEU11:A.N (остовный азот 11-го остатка цепи А)
Cα10 - C10 129,05°
ω
  1. LEU10:A.CA (альфа-углерод 10-го остатка цепи А)
  2. LEU10:A.C (карбонильный углерод 10-го остатка цепи А)
  3. SER11:A.N (остовный азот 11-го остатка цепи А)
  4. SER11:A.CA (альфа-углерод 11-го остатка цепи А)
C10 - N11 -169,22°


Изображение, иллюстрирующее определение угла

Phi


Карты Рамачандрана для следующих множеств аминокислотных остатков

  1. все остатки заданного белка;
  2. все остатки пролина заданного белка
  3. все остатки глицина заданного белка;
  4. все остатки в α-спиралях;
  5. все остатки в β-листах.

Ramachandran Комментарий
Ramachandran Комментарий

Вычисления проведены с помощью Excel



© Gordeyev Mikhail