Таблица. Измерение торсионных углов остатка nadE в белке NADE_BACSU, цепь А

Название
двугранного
угла 		Угол определяется по координатам атомов
(обращение к атому в соответствие с синтаксисом RasMol,
в скобках - название атома) 		Данный угол описывает
поворот вокруг связи 		Результат измерения
с помощью RasMol
φ
  1. GLU9:A.C(карбонильный углерод 9-го остатка цепи А)
  2. LEU10:A.N(азот 10-го остатка цепи А)
  3. LEU10:A.CA(α-углерод 10-го остатка цепи А)
  4. LEU10:A.C(карбонильный углерод 10-го остатка цепи А)
 Ni - Cαi -92.3
ψ
  1. LEU10:A.N(азот 10-го остатка цепи А)
  2. LEU10:A.CA(α-углерод 10-го остатка цепи А)
  3. LEU10:A.C(карбонильный углерод 10-го остатка цепи А)
  4. HIS11:A.N(азот 11-го остатка цепи А)
 Ciα - Ci -0.1
ω
  1. LEU10:A.CA(α-углерод 10-го остатка цепи А)
  2. LEU10:A.C(карбонильный углерод 10-го остатка цепи А)
  3. HIS11:A.N(азот 11-го остатка цепи А)
  4. HIS11:A.CA(α-углерод 11-го остатка цепи А)
 Ci - Ni+1 174.7



Определение угла φ


Карта Рамачандрана

Вывод: В моём белке есть как правозакрученные α-спирали, так и левозакрученные α-спирали.

Анализ данных в Exel
© Dzama Margarita,2009-2010