1. UCSC

Я выбрала белок PCNA ( Proliferating cell nuclear antigen). Он представляет собой кольцо, чеез центральную пору котого проходит ДНК. Основная функция PCNA- увеличение процессивности полимеразы, также учавствует в репарации ДНК.
1) Короткое имя гена- ATLD2, полное- PCNA
2) Закодирован на обратной цепи
3) Находится в 20 хромосме
4) Плечо и полоса хромосомы: 20p12.3
5) Координаты гена в хромосоме: chr20:5,114,953-5,126,626
6) Для этого гена были найдены два варианта транскрипта, кодирующих один и тот же белок, однако один длинее другого на 7131 нуклеотид, и в итоге в более длинной последовательности на один экзон больше.
7)

2. Ensembl

-ссылка на файл с выравниванием
-выдача distmat: ссылка
- таблица полиморфизмов: ccылка

Итог: как можно судить по результатам программы distmat, существенной разницы между генами белка PCNA у человека и шимпанзе нет. Однако в популяции довольно много различных полиморфизмов данного гена.


© Nenartovich Marina 2017