Общая информация
Идентификаторы протеомов:
М.jannaschii-UP000000805
E.Coli K12-UP000000625
Количество последовательностей:
в протеоме М.jannaschii- 1787
в протеоме E.Coli K12-4313
Количество аминокислот в протеоме:
М.jannaschii-505150
E.Coli K12-723791
Частоты остатков в протеомах
| Остаток |
% в М.jannaschii |
% в E.Coli K12 |
Разность % |
| I |
10,5 |
6,01 |
4,49 |
| K |
10,39 |
4,41 |
5,98 |
| L |
9,44 |
10,68 |
1,24 |
| E |
8,66 |
5,77 |
2,89 |
| V |
6,8 |
7,07 |
0,27 |
| G |
6,33 |
7,37 |
1,04 |
| D |
5,52 |
5,15 |
0,37 |
| A |
5,47 |
9,51 |
4,04 |
| N |
5,29 |
3,94 |
1,35 |
| S |
4,5 |
5,8 |
1,3 |
| Y |
4,38 |
2,84 |
1,54 |
| F |
4,25 |
3,89 |
0,36 |
| T |
4,06 |
5,39 |
1,33 |
| R |
3,84 |
5,52 |
1,68 |
| P |
3,36 |
4,43 |
1,07 |
| M |
2,29 |
2,82 |
0,53 |
| Q |
1,45 |
4,44 |
2,99 |
| H |
1,43 |
2,27 |
0,84 |
| C |
1,29 |
1,16 |
0,13 |
| W |
0,73 |
1,53 |
0,8 |
На основании данных, приведенных в таблице, можно сделать следующие выводы:
1) Тремя самыми часто встречаемыми остатками в протеоме М.jannaschii являются изолейцин, лизин и лейцин, однако в протеоме
E.Coli K12 таковыми являются лейцин, аланин и глицин.
2) Три самых редких остатка в протеоме М.jannaschii: триптофан, цистеин и гистидин. Они же являются самыми редкими в протеоме
E.Coli K12.
3) Самая большая разница в пользу E.Coli K12 у аланина, а в пользу М.jannaschii- у лизина.