На главную страницу третьего семестра

Бутстреп - анализ, выполненный с помощью программы Jackknife.

Цель задания — провести бутстреп-анализ выравнивания мутированных последовательностей, соответствующих листьям дерева.

Ветви, содержащиеся в консенсусном дереве и их бутстреп-значения:


BCDEFA                                
.**...                     92.00
.***..                     86.00
.****.                     79.00


Ветви, не включенные в консенсусное дерево и их бутстреп-значения:

BCDEFA
....**                     20.00
...**.                     10.00
.*.*..                      5.00
..*.*.                      4.00
.**.*.                      3.00
.***.*                      1.00

В результате было полученно консенсусное дерево:


  

  +----------------------------------mut b
  |
  |                           +------mut c
  |                    +-92.0-|
  |             +-86.0-|      +------mut d
  |             |      |
  |      +-79.0-|      +-------------mut e
  |      |      |
  +------|      +--------------------mut f
         |
         +---------------------------mut a






Соответствующие бутстреп-значения внутренних ветвей можно видеть на кладограмме реконструированного дерева.
По топологии деревья совпалают, отличаются только длины ветвей.
На предыдущую страницу
© Андреева Мария аka mashik, 2005