На главную страницу третьего семестра
Бутстреп - анализ и визуализация деревьев в пакете PHYLIP.
Бутстреп-анализ это процесс проверки достоверности ветвей некоторого дерева.
Для этого создается большая выборка деревьев. Проводятся 100 случайных выравниваний путем последовательного удаления одной позиции и замены её на копию одной из оставшихся.
После замены половины позиций, анализируется выборка и подсчитывается сколько раз из 100 была получена интересующая ветка. Принятно считать ветвь, встречающуюся в ста деревьях, достоверной.
© Андреева Мария аka mashik, 2005