Доменная структура белка TolC


База данных PFAM включает 7426 записей с краткой характеристикой разных семейств белковых доменов, включая их множественные выравнивания. Каждый домен в PFAM описан с помощью профиля-НММ.




Согласно базе данных PFAM в белке FadR существует 4 домена.

Название домена Начальный остаток Конечный остаток Идентификатор записи Описание
GntR 27 и 233 211 и 429 PF02321 Этот домен представляет собой N-конец HTH-содержащего региона GntR как бактериальные транскрибирующие факторы. На C конце обычно находится эффектор, отвечающий за связивание, а также С-коней отвечает за олигомеризацию. Белок GntR-like может быть разделён на 6 подсемейств: MocR, YtrR, FadR, AraR, HutC и PlmA [1-2].
Pfam-B 22914 453 495 PB022914 Это участок из искусственно сгенерированной базы данных Pfam-B.



на картинке показан золотым цветом домен GntR, а голубым - участок РВ022914 из искусственно сгенерированной базы данных Pfam-B .

На первую страницу

На второй семестр

Назад