Изображение 1. Филогенетическое дерево по выравниванию представителей домена, полученному в практикуме 9. Зеленым отмечаны Metazoa, темно-синим - Fungi, берюзовым Bacteroidetes.

Гипотеза об эволюции архитектур

На изображении 1, филогенитического дерева, видно, что белки сгруппированы впервую очередь по архитектурам, а не по таксонам. Деление по таксом происходит вторично. Но везде есть исклучения. Белок C3ZGW6_BRAFL(2_M_|C3ZGW6|C3ZGW6_BRAFL/1-355), имеет вторую архитектуру, но располежен в одно большой кладе с белками с первой архитектурой. Такое постороение можно объяснить, возможным близким сходством последовательностей, в независимости от архитектуры. Если считать такое событие, как достоверное, то можно заключить некую общность происхождения архитектур на уровне Metazoa.

Внутри архитектур, несмотря на хорошее рабиение на таксоны, наблюдается некая тенденция к выделению в отдельную маленькую кладу, образующую тривиальную ветвь. Эта тенденция наблюдается исключительно у белков относящимся к Metazoa.

Вероятно, в процессе эволюции, архитектуры взаимодействоавали следующим образом. Сначала появилось архитектура 2, и в дальнейшим её измения вызвали появление архитектуры 1. Этот вывод подтверждается наличием C3ZGW6_BRAFL в группе первой архитектуры, а так же наличие её(второй архитектуры) у Bacteroidetes и Metazoa образующих одну большую группу разбиения архитектуры 2.