Информация, которую я узнала о плазмидах: Плазмид в роде Saccharomonospora 1 Она относится к Saccharomonospora glauca А в Saccharomonospora viridis плазмид 0 Длина самой короткой плазмиды 0,537 Kb Длина самой длинной плазмиды 2580,08 Kb Средняя длина плазмид 87,49355667 Kb Медиана длин плазмид 30,658 Kb
Как извлекала род из названия организма и составляла сводную таблицу по родам:
Скопировала колонку Organism/Name. В поле "данные" выбрала "Разделить по столбца" и разделила этот столбец на несколько по пробелам. Поставила в начальных ячейках первого и второго стольбца (где перед родом стоили кавычки или скобки) прочерки. Нашла в перовм столбце слово Candidatus. Скопировала на его место соответсвующие значения из второго столбца, а на место второго значений второго столбца соотвествующие значения из третьего. Удалила все стольбцы кроме первого и второго.
Дважды скопировала на новый лист (Genetia) столбец с родами. Во втором столбце удалила дубликаты (через поле "данные"). Формулой СЧЕТЕСЛИ посчитала, сколько раз повторяется каждый род. Поличенное значение численно равно количеству плазмид в каждом роде. Это то что нам надо.
Просмотрела второй столбец, где рода были написаны один раз на наличие слов, начинающихся с маленькой буквы. Нашла их в столбце родов на листе Plasmida и поставила в них и рядом (название вида) прочерки. Еще раз перекпировала это столбец на лист Generia. Убедилась, что рядом с псведородами с маленькой буквы теперь стоят нули. Удалила их из сводной таблицы по родам. Теперь роды и виды соответсвуют требованиям.
Файл с результатами анализа генов и белков Saccharomonospora viridis для 14 практикума
Мини-обзор генома и протеома Saccharomonospora viridis DSM 43017