Учебный сайт Кузнецовой Марии

Главная

Первый семестр

Второй семестр

Третий семестр

Ссылки

Об авторе

Описание белка sulfate transport protein CysZ (белок-переносчик сульфата CysZ) из генома бактерии Idiomarina loihiensis штамм L2TR

Информация о белке и его гене, полученная из записи NC_006512.1 базы данных RefSeq с полным геномом бактерии, приведена в таблице 1. На рис. 1 изображена окрестность в геноме гена описываемого белка.

Таблица 1. Информация о транспортном белке CysZ из генома Idiomarina loihiensis штамм L2TR

Вид информации	Квалификатор в записи генома	Значение
Локус гена в геноме	/locus_tag	IL1703
Имя гена	/gene	cysZ
Идентификатор гена в базе данных NCBI Gene	/db_xref=”GeneID:…”	3172469
Начало гена в геноме	-	1833704
Конец гена в геноме	-	1834444
На какой цепи кодируется ген (прямая или обратная)	-	Прямая
Длина гена (в парах нуклеотидов)	-	741
Идентификатор белка в базе данных NCBI Protein	/protein_id	YP_156085.1
Длина белка (в аминокислотных остатках)	-	246

Легко увидеть, что соседние белки разнонаправлены с белком-переносчиком сульфата CysZ, а значит, они не могут образовывать с ним оперон.

Рис. 1. Геномная окрестность гена белка-переносчика сульфата CysZ из генома бактерии Idiomarina loihiensis штамм L2TR. Ген отмечен черной рамочкой. Рисунок получен с помощью геномного браузера на сайте NCBI

О структуре белка можно узнать больше на специально посвященной этому странице.