List11.txt - 12 ID
В анализе обогащения участвовало 11 ID (Multiple mapping information: 1 ID)
В выдаче оказалось 121 GO terms (FDR P < 0.05). Ссылка на GO terms
Все категории связаны друг с другом исключительно отношениями наследования (общие и более частные категории). Высшие категории включают записи нижних категорий.
Почти все GO terms довольно близко связаны с тетрагидробиоптерином (например, с его синтезом, как у term с наименьшим FDR). Все terms включают в себя процесс синтеза этого соединения.
Тетрагидробиоптерин действительно является диолом и одной из его составных частей является птерин.
Для всех 12 узлов (ID) есть 3D структура
Некоторые белки списка оказываются просто гомологичными (например, Alkaline phosphatases ALP*) и выявляются вместе (co-occurrence, встречаются в одних и тех же организмах). Многие белки коэкспрессируются. Многие гены соседствуют (gene neighborhood). Информация о некоторых взаимодействиях получена на основе тестового анализа (видимо, взаимной встречаемости в статьях?, textmining), другие же взаимодействия доказаны экспериментально или (и) наблюдаются в курируемых БД.
Интересно, что ALPs связаны с остальным графом через GCH1 (GTP cyclohydrolase 1) и его кофактором? PTS.
Наиболее высококонсервативными являются белки PCBD1 (Pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase) и GCH1. В целом, белки (как, видимо, и вся система) не очень консервативна (вариативна).
У всех (использованных в данном анализе) организмов наблюдается очень слабая коэкспрессия генов. Это означает, что граф построен больше на других взаимосвязях (описанных в пункте 3).
Предположительно, только 2 гена человека экспрессируются вместе:
ALPPL2 - Alkaline phosphatase, placental like 2