"Особенности" белка yxiM

  1. Участок последовательности с 1 по 25 аминокислотный остаток, предположительно, является сигнальным. 
    ID   YXIM_BACSU_1;  parent: YXIM_BACSU
FT   SIGNAL        1     25       Potential.
SQ   Sequence    25 AA;
     MKKWMAAVFV MMLMLCFGGI ENVKA
//
  2. Аминокислотный остаток на 83 позиции определён неоднозначно, по разным данным там может находиться глутамат или глутамин. 
    ID   YXIM_BACSU_6;  parent: YXIM_BACSU
FT   CONFLICT     83     83       Q -> E (in Ref. 1; BAA11692).
SQ   Sequence     1 AA;
     Q
//
  3. Аминокислотные остатки под номерами 186, 354 и 357 входят в состав активного центра. 
    ID   YXIM_BACSU_3;  parent: YXIM_BACSU
FT   ACT_SITE    186    186       Nucleophile (By similarity).
SQ   Sequence     1 AA;
     S
//

ID   YXIM_BACSU_4;  parent: YXIM_BACSU
FT   ACT_SITE    354    354       By similarity.
SQ   Sequence     1 AA;
     D
//

ID   YXIM_BACSU_5;  parent: YXIM_BACSU
FT   ACT_SITE    357    357       By similarity.
SQ   Sequence     1 AA;
     H
//

Трёхмерные структуры

В PDB найдена только одна трёхмерная структура белка yxiM: PDB:2O14.

Белки, выполняющие сходную функцию

Формулировка функции белка Строка запроса Количество найденных документов
Uncharacterized esterase (([swissprot-Description:esterase*] ! [swissprot-Description:fragment*]) & [swissprot-Taxonomy:Firmicutes*]) 10
Hydrolase (([swissprot-Description:hydrolase*] ! [swissprot-Description:fragment*]) & [swissprot-Taxonomy:Firmicutes*]) 687
Belongs to the 'GDSL' lipolytic enzyme family (([swissprot-AllText:gdsl*] ! [swissprot-AllText:fragment*]) & [swissprot-Taxonomy:Firmicutes*]) 4
Belongs to the 'GDSL' lipolytic enzyme family ((([uniprot-Description:gdsl*] ! [uniprot-Description:fragment*]) & [uniprot-Taxonomy:Firmicutes*]) & [uniprot-Description:lipase*]) 537

Найденные последовательности

Наиболее удачным, по всей видимости, является четвёртый запрос, так как белок yxiM, предположительно, принадлежит семейству GDSL-липаз и имеет характерную последовательность, встречающуюся в белках этого семейства (по информации базы данных KEGG). 10 последовательностей из всех выданных на данный запрос можно посмотреть, перейдя по этой ссылке.

Информация о последовательностях

Для 10 выбранных по четвёртому запросу последовательностей была получены и сохранены ID, AC, название организма, краткое описание белка (description) и длина последовательности. Полученная информация внесена в таблицу.