Hirschia baltica

Рисунок 1. Hirschia baltica.
Условные обозначения:
• M – материнская клетка
• H – гифа (цитоплазматический стебелёк)
• B – бутон (отпочковывающаяся дочерняя клетка)
• F – жгутик

Таксономия
Домен	Bacteria
Тип	Proteobacteria
Класс	Alphaproteobacteria
Отряд	Rhodobacterales
Семейство	Hyphomonadaceae
Род	Hirshia
Вид	Hirschia baltica

Hirschia baltica была обнаружена в поверхностных водах Балтийского моря (Кильскоий фьорд, Германия, 1982 год). Типовым штаммом Hirschia baltica является IFAM 1418T (ATCC 49814, DSM 5838, KCTC 12471). Бактерия сразу же привлекла внимание исследователей необычностью своего жизненного цикла, который был назван диморфным. Он заключается в следующем: молодая бактерия подвижна, имеет жгутик. Со временем она выталкивает жгутик, на его месте синтезирует цитоплазматический стебелёк и становится сидячей. Размножается она почкованием дочерних клеток от кончика цитоплазматического стебелька.

Характеристики:
• грамотрицательная
• аэробная
• хемогетеротрофная
• мезофильная
• неспорообразующая
• почкующаяся
• свободноживущая
• подвижная
• непатогенная

Геном Hirschia baltica представлен кольцевой хромосомой и кольцевой плазмидой. В 2008 году он был секвенирован с целью выяснения генетического контроля необычного жизненного цикла бактерии. А сравнительный геномный анализ сиквенса позволил проследить филогенез таких явлений, как синтез цитоплазматического стебелька и почкование.

Информация о геноме
	Число пар нуклеотидов	Число генов	CDS¹	Гуанин и цитозин
Хромосома	3'455'622	3'119	89%	45,2%
Плазмида	84'492	68	90%	43,5%
Всего	3'540'114	3'187

¹ CDS (Coding DNA Sequence) – нуклеотидная последовательность ДНК, содержащая лишь экзоны.

Рисунок 2. Частота встречаемости различных аминокислот
в организме Hirschia baltica.

Рисунок 3. Частота встречаемости белков различной длины
в организме Hirschia baltica.

"Семейство Hyphomonadaceae класса Alphaproteobacteria состоит в основном из бактерий, обитающих в морской воде и имеющих необычную морфологию и жизненный цикл. В статье рассмотрен полный сиквенс генома Hirschia baltica, которая является вторым членом семейства Hyphomonadaceae, у которого секвенирован геном. Hirschia baltica вызывает особый интерес у исследователей благодаря своему диморфному жизненному циклу, способности синтезировать цитоплазматический стебелёк и способности к почкованию. 3'455'622 пары нуклеотидов хромосомы и 84'492 пары нуклеотидов плазмиды, несущие информацию о 3'222 белок-кодирующих генах и 44 РНК-кодирующих генах, были секвенированы в рамках Программы всеобщего секвенирования DOE Joint Genome Institute в 2008 году."
(из аннотации к статье "Complete genome sequence of Hirschia baltica type strain (IFAM 1418^T)"
автор статьи: O.Chertkov
PMID статьи: 22675580)

Читать статью "Complete genome sequence of Hirschia baltica type strain (IFAM 1418^T)" в PubMed

Литература:

О Hirschia baltica в WikipediA

О Hirschia baltica на сайте European Bioinformatics Institute

О Hirschia baltica на сайте DOE Joint Genome Institute

О Hirschia baltica в статье "Taxonomic and Phylogenetic Studies on a New Taxon of Budding, Hyphal Proteobacteria, Hirschia baltica gen. nov., sp. nov."
Наверх