Учебный сайт Олеси Климчук

Общая характеристика UVRB_BACSU

Рисунок 1. UVRB_BACSU. Оттенками красного цвета показаны α-спирали, а оттенками зелёного цвета показаны β-листы в структуре UVRB_BACSU. Более светлые оттенки соответствуют начальным отделам цепи A, а более тёмные оттенки соответствуют её концевым отделам. α-спирали цепи В показаны наиболее тёмным цветом, а β-листов цепь B не содержит. Структурной формулой показан кофермент UVRB_BACSU. Шариками показаны молекулы воды, которые связывает UVRB_BACSU (всего 68 молекул воды).
Идентификаторы
UniProt ID UVRB_BACSU
UniProt AC P37954
PDB ID 2D7D

Русское название: субъединица B эксцизионной эндонуклеазы ABC
Английское название: excinuclease ABC subunit B

Функция: эксцизионная репарация ДНК

Кодирующий ген: uvrB (находится в локусе BSU35170 ДНК Bacillus subtilis)

Рисунок 2. АДФ.
Рисунок 3. Цепь A UVRB_BACSU.
Рисунок 4. Цепь B UVRB_BACSU.

Кофермент: АДФ

Количество цепей: 2 (А и В)
Количество аминокислотных остатков: 661 (621 в цепи А и 40 в цепи В)
Аминокислотная последовательность в формате FASTA:

			
	>UVRB_BACSU: chain A                                           
	MKDRFELVSKYQPQGDQPKAIEKLVKGIQEGKKHQTLLGATGTGKTFTVS                     
	NLIKEVNKPTLVIAHNKTLAGQLYSEFKEFFPNNAVEYFVSYYDYYQPEA                     
	YVPQTDTFIEKDASINDEIDKLRHSATSALFERRDVIIIASVSCIYGLGS                     
	PEEYREMVVSLRTEMEIERNELLRKLVDIQYARNDIDFQRGTFRVRGDVV                     
	EIFPASRDEHCVRVEFFGDEIERIREVDALTGEILGDRDHVAIFPASHFV                     
	TRAEKMEKAIQNIEKELEEQLKVMHENGKLLEAQRLEQRTRYDLEMMREM                     
	GFCSGIENYSRHLTLRPPGSTPYTLLDYFPDDFMIVVDESHVTIPQVRGM                     
	FNGDQARKQVLVDHGFRLPSALDNRPLRFEEFEKHMHNIVYVSATPGPYE                     
	IEHTDEMVEQIIRPTGLLDPLIDVRPIEGQIDDLIGEIQARIERNERVLV                     
	TTLTKKMSEDLTDYLKEIGIKVNYLHSEIKTLERIEIIRDLRLGKYDVLV                     
	GINLLREGLDIPEVSLVAILDADKEGFLRSERSLIQTIGRAARNAEGRVI                     
	MYADKITKSMEIAINETKRRREQQERFNEEHGITPKTINKEIRDVIRATV                     
	AAEDKAEYKTKAAPKLSKMTK                                                  
	>UVRB_BACSU: chain B                                                   
	KERQKVVEQMEHEMKEAAKALDFERAAELRDLLLELKAEG 
			                              
		
Скачать аминокислотную последовательность UVRB_BACSU в формате FASTA

Литература:

Об эксцизионной эндонуклеазе в WikipediA
О UVRB_BACSU в Protein Data Bank Наверх
Дата последнего изменения: 07.01.13

© Олеся Климчук, 2012