Третичная структура UVRB_BACSU

Третичной структурой белка называется пространственная организация белковой молекулы, обусловленная взаимодействиями между радикалами аминокислотных остатков, в т.ч. гидрофобными взаимодействиями, дисульфидными и солевыми мостиками.

Гидрофобные взаимодействия в структуре UVRB_BACSU

Рисунок 1. Третичная структура UVRB_BACSU. Гидрофобные участки показаны серым цветом, атомы серы в них выделены жёлтым цветом. Гидрофильные участки показаны сиреневым полупрозрачным цветом.

Гидрофобные взаимодействия в молекуле белка возникают между неполярными радикалами аминокислотных остатков глицина, аланина, валина, лейцина, изолейцина, пролина, метионина, фенилаланина и триптофана. В результате в молекуле белка образуются гидрофобные ядра, окружённые гидрофильными аминокислотными остатками.

Лейциновая "молния" UVRB_BACSU

Рисунок 2. Расположение лейциновой
"молнии" в
структуре UVRB_BACSU.

Рисунок 3. Модель лейциновой "молнии" UVRB_BACSU (вид сбоку). Лейциновые аминокислотные остатки показаны структурными формулами. Соответственно, "молния" содержит шесть лейциновых аминокислотных остатков.
Но по-видимому, функциональную значимость имеют лишь четыре из них.

Рисунок 4. Модель лейциновой "молнии" UVRB_BACSU (вид сверху).

Лейциновые "молнии" в молекуле белка образуются благодаря гидрофобным взаимодействиям между радикалами лейциновых аминокислотных остатков.

Цистеиновые аминокислотные остатки UVRB_BACSU

Рисунок 5. Расположение цистеиновых аминокислотных остатков в структуре UVRB_BACSU. Соответственно, UVRB_BACSU содержит три цистеиновых аминокислотных остатка.

Дисульфидные мостики в молекуле белка образуются благодаря ковалентным связям между радикалами цистеиновых аминокислотных остатков. У UVRB_BACSU не обнаружено дисульфидных мостиков.

Солевые мостики UVRB_BACSU

Рисунок 6. Солевые мостики UVRB_BACSU. Структурными формулами показаны все заряженные аминокислотные остатки UVRB_BACSU. Красными шариками показаны атомы кислорода. Синими шариками показаны атомы азота. Подписаны длины солевых мостиков (всего 40 солевых мостиков).

Рисунок 7. Расположение одного из солевых мостиков в структуре UVRB_BACSU.

Рисунок 8. Один из солевых мостиков UVRB_BACSU. По-видимому, он стабилизирует структуру лейциновой "молнии".

Солевые мостики в молекуле белка образуются благодаря ионным связям между радикалами отрицательно заряженных аминокислотных остатков (аспарагиновой и глутаминовой кислот) и радикалами положительно заряженных аминокислотных остатков (лизина, аргинина и гистидина).

Литература:

О третичной структуре белка в WikipediA

Об аминокислотах в WikipediA Наверх