MEME
С помощью MEME был проведён поиск мотивов у репрезентативной выборки гомологов UVRB_BACSU. Результат представлен в следующей таблице:
| Мотив | Гомологи, у которых найден мотив | Длина | E-value | Sequence Logo |
| 1 | все | 50 | 1.9e-1223 |  |
| 2 | все | 50 | 1.3e-1133 |  |
| 3 | все | 50 | 2.0e-1078 |  |
| Множественное выравнивание найденных мотивов | ||
| Мотив 1 (найден в ResIII домене) |
Мотив 2 (найден в С-концевом домене) |
Мотив 3 (найден в АТФ-связывающем домене) |
|
|
|
* Локальное множественное выравнивание найденных мотивов, построенное MEME,
полностью совпадает с глобальным множественным выравниванием, построенным в программе T-Coffee.
** Множественные выравнивания найденных мотивов кликабельны.
Наверх