Домены UVRB_BACSU
Pfam
| Домены UVRB_BACSU | |||
 |
|||
| Pfam AC | Семейство | Клан | Положение в сиквенсе |
| PF04851 | ResIII - семейство res-субъединиц рестриктаз III типа. |
P-loop_NTPase - клан НТФ-гидролаз, содержащих p-петлю.
Клан состоит из 198 семейств белков-шаперонов, необходимых для образования, функционирования и распада белковых комплексов. |
10-132 |
| PF00271 |
Helicase C - семейство консервативных С-концевых доменов хеликаз. Семейство состоит из доменов лишь DEAD/H-хеликаз, т.к. у других хеликаз этот домен не является автономным. |
463-545 | |
| PF12344 | UvrB - семейство УФ-резистентных доменов В-белков. Домен характерен для белков бактерий, архей и эукариот. | 551-594 | |
| PF02151 | Uvr - семейство UvrB/UvrC-мотивов. | 625-660 | |
Uvr домен:
• входит в 46 архитектур
• для 12 483 белков, содержащих этот домен, известен сиквенс
• для 3 белков, содержащих этот домен, известна пространственная структура
• множественное выравнивание участков аминокислотных последовательностей, содержащих этот домен, можно посмотреть
здесь.
Uvr домен может образовывать одну архитектуру с Trp_10 и Clasp_N доменами. Распределение по таксонам этих доменов представлено в следующей таблице:
| Таксон | Trp_10 домен | Clasp_N домен | |
| Эукариоты | Зеленые растения | 31 | 25 |
| Грибы | 98 | 134 | |
| Животные | 93 | 87 | |
| Остальные эукариоты | 41 | 46 | |
| Бактерии | 718 | ||
| Археи | 13 | ||
| Вирусы | 3 | ||
InterPro
По данным InterPro, UVRB_BACSU содержит шесть доменов (р-петлю-содержащий НТФ-гидролазный домен, АТФ-связывающий домен, ResIII домен, С-концевой домен, YAD/RRR-мотив-содержащий домен и Uvr домен), ещё шесть доменов найдены по IPR. Самым коротким является UVR домен (ссылка на Pfam). Самым длинным является АТФ-связывающий домен (ссылка на SMART).
Наверх