Практикум 1
В блоке по молекулярной филогении я выбрала работать с таксоном Artiodactyla. Парнокопытные (Artiodactyla) и китообразные (Cetacea) традиционно рассматривались в качестве двух самостоятельных отрядов. Однако, как показывают молекулярно-генетические и палеонтологические данные, парнокопытные не являются монофилетической группой, поскольку не включают произошедших от них китообразных, из-за чего теперь их обычно объединяют в отряд китопарнокопытных (Cetartiodactyla) либо, в некоторых системах классификации, старое название Artiodactyla используется по отношению к отряду, объединяющему парнокопытных и китообразных (далее будет использоваться старое название).
| Вид | Таксономия | Мнемоника |
|---|---|---|
| Bos taurus (Домашний бык) | Eumetazoa; Bilateria; Deuterostomia; Chordata; Craniata; Vertebrata; Gnathostomata; Teleostomi; Euteleostomi; Sarcopterygii; Dipnotetrapodomorpha; Tetrapoda; Amniota; Mammalia; Theria; Eutheria; Boreoeutheria; Laurasiatheria; Artiodactyla; Ruminantia; Pecora; Bovidae; Bovinae; Bos | BOVIN |
| Ovis aries (Домашняя овца) | Artiodactyla; Ruminantia; Pecora; Bovidae; Caprinae; Ovis | SHEEP |
| Cervus nippon (Пятнистый олень) | Artiodactyla; Ruminantia; Pecora; Cervidae; Cervinae; Cervus | CERNI |
| Alces alces cameloides (Амурский лось) | Artiodactyla; Ruminantia; Pecora; Cervidae; Odocoileinae; Alces; Alces alces | ALCAC |
| Tragulus napu (Большой оленёк) | Artiodactyla; Ruminantia; Tragulina; Tragulidae; Tragulus | TRANA |
| Orcaella brevirostris (Иравадийский дельфин) | Artiodactyla; Whippomorpha; Cetacea; Odontoceti; Delphinidae; Orcaella | ORCBR |
| Tursiops truncatus (Афалина) | Artiodactyla; Whippomorpha; Cetacea; Odontoceti; Delphinidae; Tursiops | TURTR |
| Delphinapterus leucas (Белуха) | Artiodactyla; Whippomorpha; Cetacea; Odontoceti; Monodontidae; Delphinapterus | DELLE |
| Balaenoptera acutorostrata (Северный малый полосатик) | Artiodactyla; Whippomorpha; Cetacea; Mysticeti; Balaenopteridae; Balaenoptera | BALAC |
| Eschrichtius robustus (Серый кит) | Artiodactyla; Whippomorpha; Cetacea; Mysticeti; Eschrichtiidae; Eschrichtius | ESCRO |
Далее по таксономической информации было построено разрешённое филогенетическое дерево в программе ITOL.
Использовалась скобочная формула дерева в формате Newick:
((((BOVIN, SHEEP), (CERNI, ALCAC)), TRANA), (( (ORCBR, TURTR), DELLE), (BALAC, ESCRO)));
