На главную страницу
На главную страницу второго семестра

Отчет по работе с БД InterPro

Проведен поиск по AC белка AROE_ECOLI в БД InterPro.
Найдено 3 документа, я выбрал документ, описывающий мотив, соответствующий N-концевому субстрат-связывающему домену (см. "Подробное описание домена PF08501").

идентификатор документа: IPR013708
полное название: IPR013708 Shikimate dehydrogenase substrate binding, N-terminal
общее количество белков, в которых обнаружены соответствующие мотивы: 646

Данная подпись не состоит в отношении родства с другими подписями, но находится в отношении вложенности с документами:
    IPR008289 Pentafunctional AroM protein
    IPR010110 Shikimate-5-dehydrogenase
    IPR011342 Quinate/Shikimate 5-dehydrogenase

Изображение подписей в белке AROE_ECOLI:

Подписи из БД Pfam окрашены синим.

Далее приведена таблица, описывающая все найденные подписи и базы данных, в которых они были найдены:

Название подписи Положение в последовательности aroE_Ecoli Полное название базы данных Название организации, поддерживающей данную БД Город и страна

Shikimate_DH 106 – 223 Pfam Wellcome Trust Sanger Institute
(на этом сервере мы работали, есть и другие сервера в других странах) Великобритания, Кембридж

aroE 2 – 271 TIGRFAMs The Institute for Genomic Research США, Роквилль

Shikimate_dh_N 6 – 88 Pfam Wellcome Trust Sanger Institute Великобритания, Кембридж

Название подписи	Положение в последовательности aroE_Ecoli	Полное название базы данных	Название организации, поддерживающей данную БД	Город и страна
Shikimate_DH	106 – 223	Pfam	Wellcome Trust Sanger Institute (на этом сервере мы работали, есть и другие сервера в других странах)	Великобритания, Кембридж
aroE	2 – 271	TIGRFAMs	The Institute for Genomic Research	США, Роквилль
Shikimate_dh_N	6 – 88	Pfam	Wellcome Trust Sanger Institute	Великобритания, Кембридж