Химическое строение нуклеиновых кислот
Целью данного практикума было изучение работы ChemSketch.
Для этого предлагалось выполнить несколько заданий. Zip-архив файлов этого практикума в формате .sk2 можно скачать по этой ссылке. Первое из них состояло в том, чтобы нарисовать структуры четырех соединений - 2'-дезоксигуанозиндифосфата, 2'-дезокситимидинмонофосфата, уридина, псевдоуридина и оформить ихзаданным образом.
Результаты этого задания можно увидеть на
Рис. 1. Структуры 2'-дезоксигуанозиндифосфата, 2'-дезокситимидинмонофосфата, уридина, псевдоуридина. N-гликозидные связи изображены красным цветом.
Во втором задании предлагалось изобразить двухцепочечную ДНК, повторив оформление рисунка, использовавшегося на занятии. Результат выполнения этого задания можно увидеть на рис. 2.Рис. 2. Структура ДНК. Сахарофосфатный остов выделен красным цветом.
В дополнительном задании в моем случае предполагалось рассмотреть каноническую пару цитозин-гуанин и предположить, в какие неканонические взаимодействия может вступать цитозин. Результаты выполнения этих заданий можно увидеть на рис. 3, рис. 4, рис. 5.Рис. 3. Канонические и неканонические пары с цитозином.
Рис. 4. Неканонические пары с таутомером цитозина.
Рис. 5. Возможные взаимодействия с участием сахаро-фосфатной части нуклеотида.