Лого сайта
Что такое филогенетическое дерево

Выборка бактерий для работы

Для составления дерева были выбраны 8 бактерий, представленные в Таблице 1.

Таблица 1. Набор данных для работы.
Название Мнемоника
Bacillus anthracis BACAN
Clostridium botulinum CLOB1
Enterococcus faecalis ENTFA
Finegoldia magna FINM2
Geobacillus kaustophilus GEOKA
Lactobacillus acidophilus LACAC
Listeria monocytogenes LISMO
Staphylococcus aureus STAA1

Дерево выбранных бактерий

Для набора бактерий, представленных в Таблице 1 построено филогенетическое дерево, представленное на Рисунке 1.

Рисунок 1. Филогенетическое дерево для бактерий из Таблицы 1.
Построено при помощи сервиса TreeVector

Филогенетическое дерево, представленное на Рисунке 1 имеет следующую скобочную формулу и список нетривиальных ветвей:

Скобочная формула дерева на Рисунке 1

((CLOB1,FINM2),((LACAC,ENTFA),(STAA1,(LISMO,(GEOKA,BACAN)))));

Нетривиальные ветви дерева на Рисунке 1


{CLOB1,FINM2} против {LACAC,ENTFA,STAA1,LISMO,GEOKA,BACAN}
{LACAC,ENTFA} против {STAA1,LISMO,GEOKA,BACAN,CLOB1,FINM2}
{LACAC,ENTFA,CLOB1,FINM2} против {STAA1,LISMO,GEOKA,BACAN}
{LACAC,ENTFA,CLOB1,FINM2,STAA1} против {LISMO,GEOKA,BACAN}
{LACAC,ENTFA,CLOB1,FINM2,STAA1,LISMO} против {GEOKA,BACAN}