Изучение файла структурных факторов
Для работы использована структура с PDBID 2Z3B.
Рассмотрим файл структурных факторов, размещенный на сайте PDB в формате 
mmCIF.
Данный файл содержит информацию обо всех структурных факторах, полученных в эксперименте.
Эта же информация представленна в виде xls-файла.
Пример информации представленной в файле структурных факторов
Общая информация
- дата создания (_audit)
- параметры элементарной ячейки (_cell)
- длина волны излучения, использовавшегося в диффракционном эксперименте (_diffrn_radiation_wavelength)
- данные о записи (_entry)
- экспериментально полученные параметры кристалла (поле _exptl_crystal)
- детали о шкале измерения структурных факторов (поле _reflns_scale)
- тип симметрии (поле _symmetry)
Информация для каждого измерения.
- номер записи EXPTL_CRYSTAL параметров кристалла (_refln.crystal_id)
- номер записи DIFFRN_RADIATION о длине волны(_refln.wavelength_id)
- номер записи REFLNS_SCALE о шкале(_refln.scale_group_code)
- индексы рефлекса h(_refln.index_h)
- индексы рефлекса k(_refln.index_k)
- индексы рефлекса l(_refln.index_l)
- включен ли фактор в оптимизацию модели и подсчет R фактора (_refln.status)
- значение структурного фактора(_refln.F_meas_au)
- стандартное отклонение структурного фактора(_refln.F_meas_sigma_au)
Всего в файле содержатся записи о 90900 структурных факторах, для оптимизации использовалось 86324.
Пример неизмеренных структурных факторов
| h | k | l |
| -73 | 1 | 13 |
| -73 | 2 | 10 |
| -73 | 2 | 11 |
| -73 | 4 | 10 |
| -72 | 0 | 5 |
| 5 | 4 | 0 |
| 5 | 4 | 1 |
| 5 | 4 | 2 |
| 5 | 4 | 3 |
| 5 | 4 | 5 |
| 5 | 4 | 6 |
| 5 | 4 | 0 |
Таблица 1. Пример не измеренных рефлексов.
В таблице 1 приведены индексы некоторых пропущенных факторов .