Работа с программой BLAST

Второй семестр На главную
Матрицы переходов глобального и локального выравнивания Программы построения выравниваний Работа с программой BLAST

Результат поиска последовательности моего белка (ampC_EColi) программой BLASTP в банке swissprot


Порядковый номер: 1 (113726).
Score = 774.
E-value = 0.0.

Результат поиска последовательности моего белка (ampC_EColi) программой BLASTP в банке PDB


PDB код: 1KVM.
Идентификаторы цепей: 20151087.
Score = 737.
E-value = 0.0.
Начало выравнивания входной последовательности = 20.
Конец выравнивания входной последовательности = 377.
Начало выравнивания находки = 1.
Конец выравнивания находки = 358.
Odentity = 100%.

Результат поиска последовательности гомолога моего белка программой BLASTP в банке swissprot


Порядковый номер: 3.
Score = 536.
E-value = 5e-152.
Начало выравнивания входной последовательности = 2.
Конец выравнивания входной последовательности = 381.
Начало выравнивания находки = 1.
Конец выравнивания находки = 377.
Odentity = 69%.

Аминокислотную последовательность гомолога можно посмотреть тут.

Результат поиска последовательности части последовательности моего белка программой BLASTP в банке swissprot


Порядковый номер: 1
Score=28.5
E-value=4.3
Начало выравнивания входной последовательности=250
Конец выравнивания входной последовательности=262
Начало выравнивания находки=10
Конец выравнивания находки=22
Odentity=92%

Аминокислотную последовательность части мого белка можно посмотреть тут.
©Виктор Соколов