Метаболические пути фермента MAPKK2

На сервере KEGG был найден белок MAP киназы киназы 2 (MEK2) человека - hsa:5605. Этот фермент участвует в огромном количестве (41) метаболических путей, которые отражены в таблице (click to see here).

Один из таких каскадов - щелевые контакты синапса, в которых участвует MAPKK2, представлен на рис.1.


Рис.1 Каскад реакций синаптической щели. MAPKK2 выделена красным.

Поиск в KEGG структурных формул

На сервере KEGG в разделе KEGG LIGAND была найдена информация об аминокислоте L-триптофан и гормоне мелатонин. Полученные сведения внесены в таблицу 2.

Таблица 2. Сведения о химических соединениях
Название на русском L-триптофан мелатонин
Название на английском L-Tryptophan melatonin
Идентификатор C00078 C01598
Структурная формула

Метаболический путь

На сервере KEGG в разделе KEGG PATHWAYS найден метаболический путь, соединяющий L-триптофан и мелатонин:
Карта: метаболизм триптофана (Tryptophan metabolism)
Путь: триптофан → 5-гидрокситриптофан → серотонин → N-ацетилсеротонин → мелатонин
Схема синтеза:

Примечательно, что все реакции идут только в одном направлении. Найденная карта с необходимой раскраской представлена на рисунке 2.


Рис.2 Цепочка ферментативных реакций на карте метаболизма триптофана. Цветовая раскраска: триптофан, промежуточные соединения, мелатонин.