Рентгеноструктурный анализ

Изучение файла структурных факторов

Текст задания: Изучение файла структурных факторов.

Файл структурных факторов

В данном практикуме я продолжила изучать расшифровку структуры лакказы (4jhu). Файл структурных факторов был скачан с сайта PDBe, вот он: 4jhu_str_fact.txt.

В соответствии с заданием, из файла структурных факторов были взяты колонки h, k, l, status, F, sigmaF. Все эти данные были собраны в excel-таблицу, и к ним добавлена еще одна колонка - signal - сила сигнала, рассчитанная как F/sigmaF.

Сила сигнала и статус

Измерение структурного фактора считается хорошим, если уровень сигнала ⩾ 3. Таких структурных факторов в моей структуре оказалось: 43846. Для оптимизации модели (status = o) было использовано 46762 структурных факторов.

Примеры "пропущенных" троек h,k,l

Считая, что тройка точно пропущена, если ее нет среди измеренных структурных факторов, но есть измеренный структурный фактор (h', k', l') с h' ⩾ h, k' ⩾ k, l' ⩾ l (см текст задания), я выбрала следующие, представленные в таблице 1.

Таблица 1. Примеры "пропущенных" троек h,k,l

h k l F

0 0 10 ?

12 35 31 ?

0 5 3 ?

1 35 5 ?

2 2 5 ?

9 37 30 ?

Итоговая таблица

Excel-таблица 4jhu_str_fact.xls

Signal ⩾ 3 43846

Число структурных факторов, использованных для оптимизации модели 46762

Семестр 7