28.09.2008
Описание гена "clpB" и его продукта

  Коментарии
Краткое название гена clpB  
Синонимы None  
На какой цепи расположен Обратная  
Номер первого нуклеотида кодирующей последовательности гена 2729620  
Номер последнего нуклеотида кодирующей последовательности гена 2732193  
Первый кодон гена TTA Первый кодон выглядит как TTA, которому по принципу комплиментарности соответствует кодон TAA - стоп-кодон.
Стоп-кодон CAT Комплиментарный кодон - ATG - старт-кодон. Это доказывает, что ген действительно находится на комплиментарной цепи молекулы ДНК. Траскрипция идет по направлению 5' - 3' на комплиментарной цепи, поэтому в тексте генетического кода мы сначала находим стоп-кодоном, а потом, исследуя, доходим до старт-кодона.
Имя локуса b2592  
Идентификаторы белка в базе данных UniprotKB CLPB_ECOLI  
Полное название белка ClpB protein (heat shock protein f84.1)  
Дополнительная информация о белке f857; 99 pct identical to CLPB_ECOLI SW: P03815  



Аминокислотная последовательность в fasta формате:

                    >CLPB_ECOLI ClpB protein (heat shock protein f84.1)
                                  MRLDRLTNKFQLALADAQSLALGHDNQFIEPLHLMSALLNQEGG
                    SVSPLLTSAGINAGQLRTDINQALNRLPQVEGTGGDVQPSQDLVRVLNLCDKLAQKRG
                    DNFISSELFVLAALESRGTLADILKAAGATTANITQAIEQMRGGESVNDQGAEDQRQA
                    LKKYTIDLTERAEQGKLDPVIGRDEEIRRTIQVLQRRTKNNPVLIGEPGVGKTAIVEG
                    LAQRIINGEVPEGLKGRRVLALDMGALVAGAKYRGEFEERLKGVLNDLAKQEGNVILF
                    IDELHTMVGAGKADGAMDAGNMLKPALARGELHCVGATTLDEYRQYIEKDAALERRFQ
                    KVFVAEPSVEDTIAILRGLKERYELHHHVQITDPAIVAAATLSHRYIADRQLPDKAID
                    LIDEAASSIRMQIDSKPEELDRLDRRIIQLKLEQQALMKESDEASKKRLDMLNEELSD
                    KERQYSELEEEWKAEKASLSGTQTIKAELEQAKIAIEQARRVGDLARMSELQYGKIPE
                    LEKQLEAATQLEGKTMRLLRNKVTDAEIAEVLARWTGIPVSRMMESEREKLLRMEQEL
                    HHRVIGQNEAVDAVSNAIRRSRAGLADPNRPIGSFLFLGPTGVGKTELCKALANFMFD
                    SDEAMVRIDMSEFMEKHSVSRLVGAPPGYVGYEEGGYLTEAVRRRPYSVILLDEVEKA
                    HPDVFNILLQVLDDGRLTDGQGRTVDFRNTVVIMTSNLGSDLIQERFGELDYAHMKEL
                    VLGVVSHNFRPEFINRIDEVVVFHPLGEQHIASIAQIQLKRLYKRLEERGYEIHISDE
                    ALKLLSENGYDPVYGARPLKRAIQQQIENPLAQQILSGELVPGKVIRLEVNEDRIVAVQ

Скачать отчет в формате Word:

CLPB_ECOLI.doc