Семестры
Сайт ФББ МГУ
Kodomo Wiki
NCBI
RanHummer personal web-site
Бактерия Mesorhizobium opportunistum WSM2075
- NCBI index: NC_015675
- RefSeq: CP002279
Систематика:
- Домен Bacteria
- Тип Proteobacteria
- Отряд Alphaproteobacteria
- Класс Rhizobiales
- Сем. Phyllobacteriaceae
- Род Mesorhizobium
- Вид Mesorhizobium opportunistum
- Дата регистрирования: Август 2000
- Число генов: 6685
- Страна: Австралия
- Среда: Хозяин, корень, корневой клубенек
- Трофическая роль: Симбионт
- Отношение к кислороду: Аэробный
- Хозяин: Biserrula pelecinus L
- Форма клетки: Бацилла
- Подвижность: Подвижна
- Температурный режим: Мезотермальный
- Окрашивание по Грамму: Грамм-отрицательно
- Роль симбионта: Паразит
- Болезни: Нет
Является азот-фиксаторным симбионтом бобовых растений, способствует обогащению почв азотом воздуха.
Окрестность гена, кодирующего Mutator MutT protein (YP_004610222.1)
Окрестность представлена на Рис.1
Рисунок 1. Окрестность Mesop_1646 в геноме Mesorhizobium opportunistum WSM2075. Показан фрагмент 1700502..1702697. Локус (с белком) подписан своим индексом.
Более подробная информация представлена в Табл.1.
| Конец | Локус | Направление | Рамка считывания | Белок | Длина (bp) | Длина (aa) |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 5' | Mesop_1645 | +1 | +1 | YP_004610221.1 | 777 | 258 |
| 3' | Mesop_1647 | +1 | +0 | YP_004610223.1 | 318 | 105 |
- Потенциально эти гены могут входить в один оперон.
- Расстояние до ближайшего гена с комплементарной цепи равно 2 с обеих (5' и 3') сторон.
- 5'-ген - гистон-ацетилтрансфераза, 3'-ген - гепотетический белок класса SPTR, следовательно, Mesop_1646 и Mesop_1645 могут входить в оперон контроля транскрипции.
- Если посмотреть чуть дальше, до Mesop_1644, кодирующего YP_004610220.1 (arginine biosynthesis bifunctional protein ArgJ), то вместе с ним может получиться оперон биосинтеза аргинина.