RanHummer personal web-site

Первый семестр

Изучение файлов, Far'а, последовательностей нуклеотидов и белков

• Mutator MutT protein
• Mesorhizobium opportunistum WSM2075
• Hibiscus latent Singapore virus
• Сравнение геномов млекопитающего, бактерии и вируса
• Практикумы по Excel

Второй семестр

Jmol

• Практикум 1
• Практикум 2
• Практикум 3

• Практикум 5
• Практикум 6

• Практикум 8
• Практикум 9
• Практикум 11
• Практикум 12
• Практикум 13

Третий семестр

Пространственные структуры нуклеиновых кислот

• Химическое строение нуклеиновых кислот
• A- и В- формы ДНК. Структура РНК
• Комплексы ДНК-белок

Последовательности нуклеиновых кислот

• Прочтение последовательностей по Сэнгеру
• Нуклеотидные банки данных
• Поиск по сходству (blast)
• EMBOSS
• Выравнивание геномов

Предсказание генов

• Гены прокариот
• Гены эукариот

Сборка и анализ геномов

• Ресеквенирование. Поиск полиморфизмов у человека.
• Сборка de novo

Четвертый семестр

• Что такое филогенетическое дерево
• Реконструкция филогении
• Укоренение и бутстрэп