Семестры
Сайт ФББ МГУ
Kodomo Wiki
NCBI

RanHummer personal web-site

Что такое филогенетическое дерево

Отобранные бактерии отдела Firmicutes
Название Мнемоника Таксономия
Enterococcus faecalis ENTFA Bacilli; Lactobacillales; Enterococcaceae; Enterococcus
Lactococcus lactis subsp. cremoris LACLM Bacilli; Lactobacillales; Streptococcaceae; Lactococcus; Lactococcus lactis
Staphylococcus epidermidis STAES Bacilli; Bacillales; Staphylococcaceae; Staphylococcus
Streptococcus pneumoniae serotype 4 STRPN Bacilli; Lactobacillales; Streptococcaceae; Streptococcus; Streptococcus pneumoniae
Bacillus subtilis BACSU Bacilli; Bacillales; Bacillaceae; Bacillus; Bacillus subtilis group
Finegoldia magna FINM2 Tissierellia; Tissierellales; Peptoniphilaceae; Finegoldia
Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus LACDA Bacilli; Lactobacillales; Lactobacillaceae; Lactobacillus; Lactobacillus delbrueckii

Скобочная формула дерева: (FINM2,((LACDA,(ENTFM,(LACLM,STRPN))),(BACSU,STAES)));

Изображение дерева:

Дерево содержит 4 нетривиальные ветви:

  1. {BACSU, STAES} vs {FINM2, LACDA, ENTFM, STRPN, LACLM} - выделяет Bacillales (слева)
  2. {BACSU, STAES, FINM2} vs {LACDA, ENTFM, STRPN, LACLM} - выделяет Lactobacillales (справа)
  3. {BACSU, STAES, FINM2, LACDA} vs {ENTFM, STRPN, LACLM} - выделяет Lactobacillales (кроме Lactobacillaceae (LACDA)) (справа)
  4. {BACSU, STAES, FINM2, LACDA, ENTFM} vs {STRPN, LACLM} - выделяет Streptococcaceae (справа)
© Поляков Игорь aka RanHummer