Краткое описание генома вируса
Bovine viral diarrhea virus 1 (BVDV-I)

Bovine viral diarrhea virus I (BVDV-I), или вирус диареи крупного рогатого скота — это РНК(+)-вирус рода Pestivirus. Этот вирус вызывает заболевание (диарею крупного рогатого скота, как следует из названия), распространённое по всей территории Земли.

Фотография заражённого барана

Это заболевание может привести к тяжёлым последствиям: лихорадке, воспалению слизистых оболочек, конъюктивитву. В некоторых случаях заболевание может вызвать аборты и даже смертельный исход [1].

Передача вируса может происходить несколькими путями. Во-первых, это непосредственное взаимодействие с инфецированными особями (заражение происходит через их выделения). Также вирус может передаться венерическим путём: например, при использовании искуственного оплодотворения [2].

После попадания на слизистую оболочку рта, носовой полости или мочеполовых путей, BVDV размножается в эпителиальных клетках. Оттуда вирус попадает в локальные лимфатические сосуды, а потом — в кровяное русло. BVDV спокойно размножается в лейкоцитах, в частности лимфоцитах [3] и моноцитах. Потенциально вирус может оказаться в любой ткани заражённого животного, однако «предпочтение» он отдаёт лимфатическим узлам, а особенно тимусу и подвздошной кишке.

В таблице 1 приведены некоторые характеристики BVDV [4].

Ниже приведена аминокислотная последовательность полипротеина оговариваемого вируса. 

>NP_040937.1 Bovine viral diarrhea virus 1, polyprotein
MELITNELLYKTYKQKPVGVEEPVYDQAGDPLFGERGAVHPQSTLKLPHKRGERDVPTNL 
ASLPKRGDCRSGNSRGPVSGIYLKPGPLFYQDYKGPVYHRAPLELFEEGSMCETTKRIGR 
VTGSDGKLYHIYVCIDGCIIIKSATRSYQRVFRWVHNRLDCPLWVTTCSDTKEEGATKKK 
TQKPDRLERGKMKIVPKESEKDSKTKPPDATIVVEGVKYQVRKKGKTKSKNTQDGLYHNK 
NKPQESRKKLEKALLAWAIIAIVLFQVTMGENITQWNLQDNGTEGIQRAMFQRGVNRSLH 
GIWPEKICTGVPSHLATDIELKTIHGMMDASEKTNYTCCRLQRHEWNKHGWCNWYNIEPW 
ILVMNRTQANLTEGQPPRECAVTCRYDRASDLNVVTQARDSPTPLTGCKKGKNFSFAGIL 
MRGPCNFEIAASDVLFKEHERISMFQDTTLYLVDGLTNSLEGARQGTAKLTTWLGKQLGI 
LGKKLENKSKTWFGAYAASPYCDVDRKIGYIWYTKNCTPACLPKNTKIVGPGKFGTNAED 
GKILHEMGGHLSEVLLLSLVVLSDFAPETASVMYLILHFSIPQSHVDVMDCDKTQLNLTV 
ELTTAEVIPGSVWNLGKYVCIRPNWWPYETTVVLAFEEVSQVVKLVLRALRDLTRIWNAA 
TTTAFLVCLVKIVRGQMVQGILWLLLITGVQGHLDCKPEFSYAIAKDERIGQLGAEGLTT 
TWKEYSPGMKLEDTMVIAWCEDGKLMYLQRCTRETRYLAILHTRALPTSVVFKKLFDGRK 
QEDVVEMNDNFEFGLCPCDAKPIVRGKFNTTLLNGPAFQMVCPIGWTGTVSCTSFNMDTL 
ATTVVRTYRRSKPFPHRQGCITQKNLGEDLHNCILGGNWTCVPGDQLLYKGGSIESCKWC 
GYQFKESEGLPHYPIGKCKLENETGYRLVDSTSCNREGVAIVPQGTLKCKIGKTTVQVIA 
MDTKLGPMPCRPYEIISSEGPVEKTACTFNYTKTLKNKYFEPRDSYFQQYMLKGEYQYWF 
DLEVTDHHRDYFAESILVVVVALLGGRYVLWLLVTYMVLSEQKALGIQYGSGEVVMMGNL 
LTHNNIEVVTYFLLLYLLLREESVKKWVLLLYHILVVHPIKSVIVILLMIGDVVKADSGG 
QEYLGKIDLCFTTVVLIVIGLIIARRDPTIVPLVTIMAALRVTELTHQPGVDIAVAVMTI 
TLLMVSYVTDYFRYKKWLQCILSLVSAVFLIRSLIYLGRIEMPEVTIPNWRPLTLILLYL 
ISTTIVTRWKVDVAGLLLQCVPILLLVTTLWADFLTLILILPTYELVKLYYLKTVRTDTE 
RSWLGGIDYTRVDSIYDVDESGEGVYLFPSRQKAQGNFSILLPLIKATLISCVSSKWQLI 
YMSYLTLDFMYYMHRKVIEEISGGTNIISRLVAALIELNWSMEEEESKGLKKFYLLSGRL 
RNLIIKHKVRNETVASWYGEEEVYGMPKIMTIIKASTLSKSRHCIICTVCEGREWKGGTC 
PKCGRHGKPITCGMSLADFEERHYKRIFIREGNFEGMCSRCQGKHRRFEMDREPKSARYC 
AECNRLHPAEEGDFWAESSMLGLKITYFALMDGKVYDITEWAGCQRVGISPDTHRVPCHI 
SFGSRMPFRQEYNGFVQYTARGQLFLRNLPVLATKVKMLMVGNLGEEIGNLEHLGWILRG 
PAVCKKITEHEKCHINILDKLTAFFGIMPRGTTPRAPVRFPTSLLKVRRGLETAWAYTHQ 
GGISSVDHVTAGKDLLVCDSMGRTRVVCQSNNRLTDETEYGVKTDSGCPDGARCYVLNPE 
AVNISGSKGAVVHLQKTGGEFTCVTASGTPAFFDLKNLKGWSGLPIFEASSGRVVGRVKV 
GKNEESKPTKIMSGIQTVSKNRADLTEMVKKITSMNRGDFKQITLATGAGKTTELPKAVI 
EEIGRHKRVLVLIPLRAAAESVYQYMRLKHPSISFNLRIGDMKEGDMATGITYASYGYFC 
QMPQPKLRAAMVEYSYIFLDEYHCATPEQLAIIGKIHRFSESIRVVAMTATPAGSVTTTG 
QKHPIEEFIAPEVMKGEDLGSQFLDIAGLKIPVDEMKGNMLVFVPTRNMAVEVAKKLKAK 
GYNSGYYYSGEDPANLRVVTSQSPYVIVATNAIESGVTLPDLDTVIDTGLKCEKRVRVSS 
KIPFIVTGLKRMAVTVGEQAQRRGRVGRVKPGRYYRSQETATGSKDYHYDLLQAQRYGIE 
DGINVTKSFREMNYDWSLYEEDSLLITQLEILNNLLISEDLPAAVKNIMARTDHPEPIQL 
AYNSYEVQVPVLFPKIRNGEVTDTYENYSFLNARKLGEDVPVYIYATEDEDLAVDLLGLD 
WPDPGNQQVVETGKALKQVTGLSSAENALLVALFGYVGYQALSKRHVPMITDIYTIEDQR 
LEDTTHLQYAPNAIKTDGTETELKELASGDVEKIMGAISDYAAGGLEFVKSQAEKIKTAP 
LFKENAEAAKGYVQKFIDSLIENKEEIIRYGLWGTHTALYKSIAARLGHETAFATLVLKW 
LAFGGESVSDHVKQAAVDLVVYYVMNKPSFPGDSETQQEGRRFVASLFISALATYTYKTW 
NYHNLSKVVEPALAYLPYATSALKMFTPTRLESVVILSTTIYKTYLSIRKGKSDGLLGTG 
ISAAMEILSQNPVSVGISVMLGVGAIAAHNAIESSEQKRTLLMKVFVKNFLDQAATDELV 
KENPEKIIMALFEAVQTIGNPLRLIYHLYGVYYKGWEAKELSERTAGRNLFTLIMFEAFE 
LLGMDSQGKIRNLSGNYILDLIYGLHKQINRGLKKMVLGWAPAPFSCDWTPSDERIRLPT 
DNYLRVETRCPCGYEMKAFKNVGGKLTKVEESGPFLCRNRPGRGPVNYRVTKYYDDNLRE 
IKPVAKLEGQVEHYYKGVTAKIDYSKGKMLLATDKWEVEHGVITRLAKRYTGVGFNGAYL 
GDEPNHRALVERDCATITKNTVQFLKMKKGCAFTYDLTISNLTRLIELVHRNNLEEKEIP 
TATVTTWLAYTFVNEDVGTIKPVLGERVIPDPVVDINLQPEVQVDTSEVGITIIGRETLM 
TTGVTPVLEKVEPDASDNQNSVKIGLDEGNYPGPGIQTHTLTEEIHNRDARPFIMILGSR 
NSISNRAKTARNINLYTGNDPREIRDLMAAGRMLVVALRDVDPELSEMVDFKGTFLDREA 
LEALSLGQPKPKQVTKEAVRNLIEQKKDVEIPNWFASDDPVFLEVALKNDKYYLVGDVGE 
LKDQAKALGATDQTRIIKEVGSRTYAMKLSSWFLKASNKQMSLTPLFEELLLRCPPATKS 
NKGHMASAYQLAQGNWEPLGCGVHLGTIPARRVKIHPYEAYLKLKDFIEEEEKKPRVKDT 
VIREHNKWILKKIRFQGNLNTKKMLNPGKLSEQLDREGRKRNIYNHQIGTIMSSAGIRLE 
KLPIVRAQTDTKTFHEAIRDKIDKSENRQNPELHNKLLEIFHTIAQPTLKHTYGEVTWEQ 
LEAGVNRKGAAGFLEKKNIGEVLDSEKHLVEQLVRDLKAGRKIKYYETAIPKNEKRDVSD 
DWQAGDLVVEKRPRVIQYPEAKTRLAITKVMYNWVKQQPVVIPGYEGKTPLFNIFDKVRK 
EWDSFNEPVAVSFDTKAWDTQVTSKDLQLIGEIQKYYYKKEWHKFIDTITDHMTEVPVIT 
ADGEVYIRNGQRGSGQPDTSAGNSMLNVLTMMYGFCESTGVPYKSFNRVARIHVCGDDGF 
LITEKGLGLKFANKGMQILHEAGKPQKITEGEKMKVAYRFEDIEFCSHTPVPVRWSDNTS 
SHMAGRDTAVILSKMATRLDSSGERGTTAYEKAVAFSFLLMYSWNPLVRRICLLVLSQQP
ETDPSKHATYYYKGDPIGAYKDVIGRNLSELKRTGFEKLANLNLSLSTLGVWTKHTSKRI 
IQDCVAIGKEEGNWLVKPDRLISSKTGHLYIPDKGFTLQGKHYEQLQLRTETNPVMGVGT 
ERYKLGPIVNLLLRRLKILLMTAVGVSS

Таблица 1. Некоторые характеристики BVDV-I
Параметр
Значение
Латинское название вируса Bovine viral diarrhea virus I
Русское название вируса Вирус диареи крупного рогатого скота
Количество фрагментов в полном геноме 1
Общая длина генома (п.н.) 12573
Количество кодируемых в геноме белков 1 (прекурсор, из которого в дальнейшем формируются несколько других белков)

Источники:

  1. WikiWet: Bovine Viral Diarrhoea Virus
  2. Kirkland, P D et al (1991) Replication of bovine viral diarrhoea virus in the bovine reproductive tract and excretion of virus in semen during acute and chronic infections. Veterinary Record, 128, 587–590.
  3. Bruschke, C J M et al (1998) Distribution of bovine virus diarrhoea virus in tissues and white blood cells of cattle during acute infection. Veterinary Microbiology, 64, 23-32.
  4. NCBI Genome: Bovine viral diarrhea virus 1

© Исаев Сергей,