Структуры, приведённые в отчёте по этому практикумы, были визуализированы при помощи программы MarvinSketch. Для того, чтобы увеличить картинку (формат .svg, кодировка адаптирована), достаточно на неё кликнуть.

I

Структуры 2'-дезоксигуанозиндифосфата, 2'-дезокситимидинмонофосфата, уридина и псевдоуридина. Макет изображения доступен по ссылке.

II

Воспроизведённое изображение фрагмента ДНК из презентации (слайд 12). Макет изображения доступен по ссылке.

III

Тимин — это азотистое основание, которое обычно входит в состав ДНК, где двумя водородными связями связывается с аденином. Его также можно встретить и в РНК: так, фермент риботимидил синтетаза превращает урацил в 54 позиции тРНК в тимин. Эта модификация встречается и у бактерий, и у архей, и у эукариот, поэтому можно предположить, что она несёт важную структурную роль, которую, возможно, не может выполнять урацил. Для того, чтобы понять, какие ещё функции гипотетически может выполнять тимин (возможно, необычные структуры, образуемые им в ДНК или в каких-либо ещё РНК, выполняют важную регуляторную роль), стоит рассмотреть все возможные водородные связи, которые образует тимин с другими азотистыми основаниями. Ниже предположены структуры водородных связей между нуклеозидом тимидином и другими нуклеозидами (в том числе и с учётом таутомерии).

Рисунок 1. Возможные водородные связи между A и T (макет)

Рисунок 2. Возможные водородные связи между C и T (макет)

Рисунок 3. Возможные водородные связи между G и T (макет)

Рисунок 4. Возможные водородные связи между T(U) и T (макет)

Сложно сказать о наиболее вероятных структурах, если речь идёт не о двойной спирали ДНК: опыт показывает, что неканонические пары могут связываться самым невероятным образом.